L’édifice, l’une des soixante-treize églises du diocèse de Bayonne consacrée à Saint Pierre, est d’une époque incertaine. La paroisse de Iruber, attestée en 1249 dans les Archives de Navarre, possédait vraisemblablement une chapelle. Une délibération du Corps de ville de Bayonne du 2 octobre 1482 prouve qu’une église existait à Saint-Pierre d’Irube.
Elle fut régulièrement citée dans les archives du XVIIème siècle. Des travaux fréquents et parfois importants la modifièrent sensiblement au XVIIIème siècle. Après la Révolution, l’église était ruinée comme le notait le maire de l’époque Salvat Dassance.
Il existe au cimetière cinq stèles ou fragments de stèles discoïdales, ainsi qu’un morceau de croix ancienne. En 1980, un fragment de stèle a été mis au jour dans la benoîterie lors de travaux d’aménagement. Ces stèles, fragments, croix sont aujourd’hui recensés par l’association « Lauburu » et sont protégés.
